Ειδικά Θέματα Υπολογιστικής Βιολογίας

Υπολογιστική Δομική Βιολογία 
Από την κρυσταλλογραφία και την τρισδιάστατη επανασύσταση, μέχρι την ελαχιστοποίηση ενέργειας και τις προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής.

Θέματα :

• Μια μη μαθηματική εισαγωγή στις κρυσταλλογραφικές μεθόδους

• Κύματα, κρύσταλλοι, σκέδαση, περίθλαση

• Το πρόβλημα των φάσεων, το κρυσταλλογραφικό πείραμα, παραγωγή ακτίνων Χ, αλληλεπίδραση ύλης/ακτίνων-Χ, ανίχνευση ακτίνων Χ

• Προσδιορισμός φάσεων: ένα παράδειγμα,

• Χάρτες ηλεκτρονικής πυκνότητας (διακριτικότητα).

• Εισαγωγή στην υπολογιστική κρυσταλλογραφία

• Μέθοδοι επίλυσης του προβλήματος των φάσεων (MIR, MAD, μοριακή αντικατάσταση, direct methods), Βελτιστοποίηση.

• Κρυσταλλογραφία ηλεκτρονίων, θεώρημα προβολών, τρισδιάστατη επανασύσταση.

• Το πρόβλημα της αναδίπλωσης των πρωτεϊνών. Μοριακή δυναμική.